MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Erwinia pyrifoliae DSM 12163 plasmid pEp5

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017389	AAG	2	6	6	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017389	GTG	2	6	32	37	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017389	GAA	2	6	58	63	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017389	AGA	2	6	107	112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017389	AAG	2	6	206	211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017389	AT	3	6	231	236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017389	CAT	2	6	345	350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017389	TTA	2	6	379	384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017389	ACA	2	6	425	430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017389	A	6	6	443	448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017389	GGAC	2	8	531	538	25 %	0 %	50 %	25 %	387873350
12	NC_017389	CAGC	2	8	566	573	25 %	0 %	25 %	50 %	387873350
13	NC_017389	ACG	2	6	656	661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873350
14	NC_017389	GCGG	2	8	725	732	0 %	0 %	75 %	25 %	387873350
15	NC_017389	GCG	2	6	795	800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873350
16	NC_017389	GAA	2	6	812	817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873350
17	NC_017389	AGC	2	6	841	846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873350
18	NC_017389	GCG	2	6	882	887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873350
19	NC_017389	GAAAG	2	10	949	958	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017389	GCT	2	6	982	987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873351
21	NC_017389	A	8	8	1010	1017	100 %	0 %	0 %	0 %	387873351
22	NC_017389	ATG	2	6	1029	1034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873351
23	NC_017389	GGT	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387873351
24	NC_017389	AT	3	6	1261	1266	50 %	50 %	0 %	0 %	387873351
25	NC_017389	ACT	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873351
26	NC_017389	ATC	2	6	1344	1349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873351
27	NC_017389	AGA	2	6	1363	1368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873351
28	NC_017389	GAT	2	6	1436	1441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873351
29	NC_017389	A	7	7	1520	1526	100 %	0 %	0 %	0 %	387873351
30	NC_017389	ATA	2	6	1542	1547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873351
31	NC_017389	GATAT	2	10	1611	1620	40 %	40 %	20 %	0 %	387873351
32	NC_017389	T	7	7	1655	1661	0 %	100 %	0 %	0 %	387873351
33	NC_017389	AAGAT	2	10	1686	1695	60 %	20 %	20 %	0 %	387873352
34	NC_017389	CAA	2	6	1736	1741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387873352
35	NC_017389	ATA	2	6	1743	1748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873352
36	NC_017389	TA	3	6	1754	1759	50 %	50 %	0 %	0 %	387873352
37	NC_017389	TAT	2	6	1782	1787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387873352
38	NC_017389	CTT	4	12	1802	1813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387873352
39	NC_017389	CTT	2	6	1856	1861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387873352
40	NC_017389	T	6	6	1860	1865	0 %	100 %	0 %	0 %	387873352
41	NC_017389	T	6	6	1871	1876	0 %	100 %	0 %	0 %	387873352
42	NC_017389	AGA	2	6	1878	1883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873352
43	NC_017389	TCTT	2	8	1909	1916	0 %	75 %	0 %	25 %	387873352
44	NC_017389	CTT	2	6	1935	1940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387873352
45	NC_017389	A	6	6	1960	1965	100 %	0 %	0 %	0 %	387873352
46	NC_017389	CCA	2	6	1978	1983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387873352
47	NC_017389	T	7	7	2030	2036	0 %	100 %	0 %	0 %	387873352
48	NC_017389	CA	4	8	2079	2086	50 %	0 %	0 %	50 %	387873352
49	NC_017389	T	6	6	2097	2102	0 %	100 %	0 %	0 %	387873352
50	NC_017389	CTC	2	6	2112	2117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387873352
51	NC_017389	GCA	2	6	2133	2138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873352
52	NC_017389	CGGA	2	8	2197	2204	25 %	0 %	50 %	25 %	387873352
53	NC_017389	GCA	2	6	2240	2245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873352
54	NC_017389	CAT	2	6	2385	2390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873353
55	NC_017389	CGCTGT	2	12	2396	2407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
56	NC_017389	TCCAGC	2	12	2414	2425	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387873353
57	NC_017389	CTG	3	9	2431	2439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
58	NC_017389	CTG	2	6	2452	2457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
59	NC_017389	GCT	2	6	2501	2506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
60	NC_017389	CCTG	2	8	2522	2529	0 %	25 %	25 %	50 %	387873353
61	NC_017389	CGCT	2	8	2545	2552	0 %	25 %	25 %	50 %	387873353
62	NC_017389	AGT	2	6	2636	2641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873353
63	NC_017389	CTG	2	6	2643	2648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
64	NC_017389	GCT	2	6	2651	2656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
65	NC_017389	TGC	2	6	2693	2698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
66	NC_017389	TTC	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387873353
67	NC_017389	GCA	2	6	2777	2782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873353
68	NC_017389	CG	3	6	2830	2835	0 %	0 %	50 %	50 %	387873353
69	NC_017389	CTG	2	6	2892	2897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
70	NC_017389	CCA	2	6	2904	2909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387873353
71	NC_017389	GAT	2	6	2955	2960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873353
72	NC_017389	GGC	2	6	3045	3050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873353
73	NC_017389	TTCTC	2	10	3056	3065	0 %	60 %	0 %	40 %	387873353
74	NC_017389	CTG	3	9	3138	3146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
75	NC_017389	C	6	6	3226	3231	0 %	0 %	0 %	100 %	387873353
76	NC_017389	ATGCTG	2	12	3245	3256	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387873353
77	NC_017389	GTG	2	6	3263	3268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387873353
78	NC_017389	CAC	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387873353
79	NC_017389	CTG	2	6	3372	3377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873353
80	NC_017389	GCTTT	2	10	3384	3393	0 %	60 %	20 %	20 %	387873353
81	NC_017389	CCG	2	6	3421	3426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873353
82	NC_017389	GCGG	2	8	3495	3502	0 %	0 %	75 %	25 %	387873353
83	NC_017389	CAG	2	6	3541	3546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873353
84	NC_017389	GCC	2	6	3579	3584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873353
85	NC_017389	T	6	6	3730	3735	0 %	100 %	0 %	0 %	387873353
86	NC_017389	TCC	2	6	3770	3775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387873353
87	NC_017389	GCA	2	6	3786	3791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873353
88	NC_017389	CAG	2	6	3823	3828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873353
89	NC_017389	GCC	3	9	3847	3855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873353
90	NC_017389	ATC	2	6	3881	3886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873353
91	NC_017389	GTT	2	6	4022	4027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387873356
92	NC_017389	AGC	2	6	4050	4055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873356
93	NC_017389	GAAG	2	8	4068	4075	50 %	0 %	50 %	0 %	387873356
94	NC_017389	CAG	2	6	4154	4159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873356
95	NC_017389	TGC	2	6	4201	4206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873356
96	NC_017389	CCT	2	6	4225	4230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017389	CGGG	2	8	4244	4251	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017389	TGG	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017389	CCT	2	6	4475	4480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017389	GCG	2	6	4515	4520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017389	AGCGGT	2	12	4537	4548	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017389	C	6	6	4622	4627	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_017389	A	6	6	4641	4646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017389	GTG	2	6	4661	4666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017389	ATC	2	6	4691	4696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017389	CCTGC	2	10	4737	4746	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_017389	TC	3	6	4759	4764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017389	TG	3	6	4840	4845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017389	C	6	6	4852	4857	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_017389	A	6	6	4923	4928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017389	GCA	2	6	4937	4942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.